在理工科学科中，论文查重软件更加注重对实验数据和科研结果的准确性和原创性检测，因为理工科研究通常依托于实验数据和模型分析。而在人文社科学科中，论文查重软件则更注重对文献引用和学术观点的核实，因为人文社科研究更偏向于文献综述和理论分析。因此，不同学科对论文查重软件的使用有着明显的差异。

此外，不同学科对于论文查重软件的要求和标准也存在差异。例如，工程技术类学科可能更加关注实验数据的一致性和技术创新性，而文学类学科可能更加关注文献引用的完整性和学术观点的独特性。因此，学术界普遍认为，论文查重软件在不同学科的应用差异是由学科特点和研究方法的不同所导致的。